与 2015 款相比，新版本采用了一副涡轮增压系统经过改进的发动机，新的涡轮增压系统中配备了电子控制的阀门，用于提高空气进入和输出该系统时的效率，厂方对这副改进过的发动机冠以 “ 平衡的增压发动机 ” （Balanced Supercharged Engine）之名，并称之为有趣的、又省油的机器。同时，变速箱采用了新设计的滑动式离合器，发动机管理系统的设置也经过更新。此外，车身也使用了新的图案。
下图：2016' Ninja “ 忍者 ” H2
下图：2016' Ninja “ 忍者 ” H2R
下图：2016' Ninja “ 忍者 ” H2/H2R 发动机及其新的电子控制阀门涡轮增压系统的特写。
下图：最初的 Ninja “ 忍者 ” H2/H2R 设计草图
