就像是自家的YZ450F统治450cc级别一样，YZ250F在250cc级别中也是非常优秀的车型，2014年雅马哈推出这一代产品之后，非常出色的表现让2016款车型没必要进行全面的升级，毕竟对手们还没有能够与之争锋的产品。也因此，除了推出了60周年黄色涂装之外，在外观上我们真的难以察觉2016款车型与2015款车型有什么区别，包括车架和车身面板都是完全相同的。
但如果你要真的被这个表象所迷惑，那你就错了。雅马哈的工程师几乎将所有的工作都放在了这台249cc水冷四冲程发动机上了。作为换代之后的第二年，雅马哈采取的改款方式依旧是针对发动机进行了一系列的改进，其中最主要的一项就是对活塞进行了再一次的重新设计。新的活塞顶端采用了水平面的设计，压缩比和2015款车型一致依旧保持在了13.5:1，活塞头表面的厚度相比2015款车型由5.5mm减少到3.8mm，为了保证足够的强度，活塞头内侧加入了加强筋。这一项改进整体比2015款车型减少了18g，同时减少了活塞的惯性，提升了动力响应，并且在低转速区间下更加稳定。
除了活塞的改进之外，雅马哈的工程师发现曲轴也有更好的解决方案。经过了重新设计的曲轴整体减少了20%的重量，这一项改进很大程度的减少了曲轴的转动惯性，提升了相应速度。此外雅马哈的工程师还对曲柄平衡块进行了优化设计，这也是和2014款、2015款车型最大的不同之一。新的曲柄平衡块设计通过调整重量配比，虽然最终的整体重量有所增加，但获得更好的响应和平顺性。雅马哈的工程师还对这台发动机的机油冷却系统进行了优化，据称相比老款发动机，新的发动机活塞的工作温度降低了10摄氏度。
虽然理论上分析出来的结果是，2016款YZ250F的发动机性能要比2015款车型更加出色，但实际真的真的驾驶新款车型的话真的很难察觉到和老款的区别，除非你是一个经验特别丰富的车手。
尽管原厂的设计已经非常完美了，但对于这种以场地竞赛为主的车型来说，后期的调教依旧是非常重要。比如川崎KX250F和铃木RM-Z250车型都可以通过点火模块的升级获得不同的动力表现，而本田CRF250R车型可以通过刷新ECU程序来获得更有针对性的动力输出。雅马哈同样也不例外，作为主要附件的GYTR Power Tunner模块程序可以通过调整喷油和点火两套系统来获得精准的控制。比如燃油喷射系统分为15级，每一级3%，最大可以调整42%的喷油量；正时点火系统分为14级，从-9度到+4度。此外这套程序还能够记录车子的行车数据，包括转速、水温、气温、油门位置等信息。
除了发动机，雅马哈对于YZ250F的变速箱也进行了一些优化以获得更加顺畅的换挡动作。这台五速变速箱更换了新的离合器片和分离轴承，换挡时的结合更加迅速，冲击也更小。此外三、四、五档之间的同步器也进行了优化，整个换挡过程更加平顺。当然最终的结果和发动机一样，理论上的确可以看得出来不少的改进，但估计大多数骑手都很难察觉到到底有什么区别。
YZ250F自2014年换代之后，铝制车架和KYB避震已经是非常出色的设计了，这次雅马哈依旧不遗余力的对这套避震进行了进一步的调整以改善高速和低速时的表现。雅马哈官方表示，尽管他们已经在努力研发空气避震的前叉，但就目前来看还是弹簧避震的前叉更好。2016款车型的后轮避震更软，弹簧预载从2015款车型的56N·m减少到了54N·m，从而减少后轮跳动带来的冲击。
说道舒适性，YZ250F的确是一款非常不错的车子，人机工程学运用的恰到好处，较平较窄的坐垫能够提供一个舒适的坐姿并且有足够的躯体活动空间，对于一款场地车来说尤其重要。另外2016款车型更换了新的270mm前制动盘和两活塞制动卡钳，这一项改进应该可以算得上是2016款车型最明显的变化了，没有之一，因为即便不是经验丰富的骑手也可以感觉得到制动效果的明显提升。
整体来说，雅马哈在2016款YZ250F车型上下了不少的功夫，虽然有很多改进都比较难以察觉，但这并不影响雅马哈继续驰骋在250cc级别。新款车型的售价7590美元起，如果想要选择这款60周年黄的涂装还需要再加100美元。
